店舗の大きな冷凍庫に食材を保管していますが、これはどうすればよいでしょうか。

十分な賞味期限を残して、どこかで売却できればよいのですが、売却先がなければ、仕入業者に引き取ってもらって赤伝を切っていただくことをお願いしてください。そのままで破産手続開始決定を迎えると、管財人としては、廃棄処分とするほかなく、却って経費負担が生じます。なので、申立て前に従業員に持ち帰ってもらうとよいでしょう。